MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. P125109 chromosome

Total Repeats: 85024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011294	CGG	2	6	118	123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855517
2	NC_011294	ACCA	2	8	230	237	50 %	0 %	0 %	50 %	207855517
3	NC_011294	TGG	2	6	240	245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855517
4	NC_011294	GAT	2	6	247	252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855517
5	NC_011294	A	6	6	255	260	100 %	0 %	0 %	0 %	207855517
6	NC_011294	CGG	2	6	265	270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855517
7	NC_011294	T	6	6	309	314	0 %	100 %	0 %	0 %	207855517
8	NC_011294	GC	3	6	339	344	0 %	0 %	50 %	50 %	207855517
9	NC_011294	CTG	2	6	428	433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855517
10	NC_011294	CGC	2	6	457	462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855517
11	NC_011294	A	6	6	480	485	100 %	0 %	0 %	0 %	207855517
12	NC_011294	GATC	2	8	541	548	25 %	25 %	25 %	25 %	207855517
13	NC_011294	CGC	2	6	622	627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855517
14	NC_011294	CCG	2	6	672	677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855517
15	NC_011294	TGG	2	6	696	701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855517
16	NC_011294	CCG	3	9	729	737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855517
17	NC_011294	GCC	2	6	743	748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855517
18	NC_011294	CTG	2	6	763	768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855517
19	NC_011294	GCT	2	6	832	837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855517
20	NC_011294	CT	3	6	869	874	0 %	50 %	0 %	50 %	207855517
21	NC_011294	TTC	2	6	891	896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855517
22	NC_011294	CGA	2	6	997	1002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855517
23	NC_011294	AAC	2	6	1037	1042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	207855517
24	NC_011294	GAT	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855517
25	NC_011294	GGC	2	6	1093	1098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855517
26	NC_011294	CGC	2	6	1108	1113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855517
27	NC_011294	GGT	2	6	1135	1140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855517
28	NC_011294	TCC	2	6	1154	1159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	207855517
29	NC_011294	TG	3	6	1181	1186	0 %	50 %	50 %	0 %	207855517
30	NC_011294	GC	3	6	1200	1205	0 %	0 %	50 %	50 %	207855517
31	NC_011294	CCG	2	6	1210	1215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855517
32	NC_011294	GCT	2	6	1255	1260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855517
33	NC_011294	TGT	2	6	1300	1305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	207855517
34	NC_011294	TTC	2	6	1346	1351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855517
35	NC_011294	AATATC	2	12	1370	1381	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	207855517
36	NC_011294	TCT	2	6	1400	1405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855517
37	NC_011294	TGG	2	6	1422	1427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855517
38	NC_011294	ACG	2	6	1434	1439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855517
39	NC_011294	CCA	2	6	1443	1448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855517
40	NC_011294	CGG	2	6	1519	1524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855517
41	NC_011294	CGG	2	6	1528	1533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855517
42	NC_011294	GAA	2	6	1573	1578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	207855517
43	NC_011294	GCG	2	6	1602	1607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855517
44	NC_011294	ATC	2	6	1731	1736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855517
45	NC_011294	TTG	2	6	1752	1757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	207855517
46	NC_011294	TCG	2	6	1850	1855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855517
47	NC_011294	ACT	2	6	1860	1865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855517
48	NC_011294	CGC	3	9	1882	1890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855517
49	NC_011294	CTG	2	6	1964	1969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855517
50	NC_011294	TGA	2	6	1978	1983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855517
51	NC_011294	CT	3	6	2018	2023	0 %	50 %	0 %	50 %	207855517
52	NC_011294	TC	3	6	2056	2061	0 %	50 %	0 %	50 %	207855517
53	NC_011294	GC	3	6	2078	2083	0 %	0 %	50 %	50 %	207855517
54	NC_011294	CG	3	6	2109	2114	0 %	0 %	50 %	50 %	207855517
55	NC_011294	GAC	2	6	2276	2281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855517
56	NC_011294	GCC	2	6	2288	2293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855517
57	NC_011294	TGA	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855517
58	NC_011294	AGGTA	2	10	2317	2326	40 %	20 %	40 %	0 %	207855517
59	NC_011294	TAT	2	6	2450	2455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	207855517
60	NC_011294	TGC	2	6	2472	2477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855517
61	NC_011294	ATG	2	6	2496	2501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855517
62	NC_011294	CGG	3	9	2505	2513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855517
63	NC_011294	AGC	2	6	2681	2686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855518
64	NC_011294	GCC	2	6	2732	2737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855518
65	NC_011294	A	7	7	2824	2830	100 %	0 %	0 %	0 %	207855518
66	NC_011294	CGT	2	6	2870	2875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855518
67	NC_011294	CGC	2	6	2876	2881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855518
68	NC_011294	ATGA	2	8	2892	2899	50 %	25 %	25 %	0 %	207855518
69	NC_011294	GCA	2	6	2971	2976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855518
70	NC_011294	TGA	2	6	3022	3027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855518
71	NC_011294	GAA	2	6	3030	3035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	207855518
72	NC_011294	ATT	2	6	3042	3047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	207855518
73	NC_011294	CAG	2	6	3051	3056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855518
74	NC_011294	TGA	2	6	3068	3073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855518
75	NC_011294	ATTGC	2	10	3160	3169	20 %	40 %	20 %	20 %	207855518
76	NC_011294	GCC	2	6	3228	3233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855518
77	NC_011294	TGA	2	6	3238	3243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855518
78	NC_011294	CG	4	8	3267	3274	0 %	0 %	50 %	50 %	207855518
79	NC_011294	GC	3	6	3322	3327	0 %	0 %	50 %	50 %	207855518
80	NC_011294	CGG	2	6	3469	3474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855518
81	NC_011294	AGT	2	6	3482	3487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855518
82	NC_011294	CAG	2	6	3573	3578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855519
83	NC_011294	T	8	8	3583	3590	0 %	100 %	0 %	0 %	207855519
84	NC_011294	TGA	2	6	3626	3631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855519
85	NC_011294	GCA	2	6	3701	3706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855519
86	NC_011294	CG	3	6	3726	3731	0 %	0 %	50 %	50 %	207855519
87	NC_011294	CGG	2	6	3824	3829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855519
88	NC_011294	GCG	2	6	3862	3867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855519
89	NC_011294	CGGCG	2	10	3908	3917	0 %	0 %	60 %	40 %	207855519
90	NC_011294	GTC	2	6	3954	3959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855519
91	NC_011294	CG	3	6	3970	3975	0 %	0 %	50 %	50 %	207855519
92	NC_011294	GGC	2	6	4017	4022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855519
93	NC_011294	TGA	2	6	4088	4093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855519
94	NC_011294	GAA	2	6	4095	4100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	207855519
95	NC_011294	GCC	2	6	4147	4152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855519
96	NC_011294	CTA	2	6	4169	4174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855519
97	NC_011294	CTG	2	6	4266	4271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855519
98	NC_011294	CGC	2	6	4307	4312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855519
99	NC_011294	GATG	2	8	4397	4404	25 %	25 %	50 %	0 %	207855519
100	NC_011294	CAGC	2	8	4406	4413	25 %	0 %	25 %	50 %	207855519
101	NC_011294	GGA	2	6	4433	4438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	207855519
102	NC_011294	CCG	2	6	4445	4450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855519
103	NC_011294	CTGA	2	8	4464	4471	25 %	25 %	25 %	25 %	207855519
104	NC_011294	GCG	2	6	4482	4487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855519
105	NC_011294	ACA	2	6	4505	4510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	207855519
106	NC_011294	GCG	2	6	4557	4562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855519
107	NC_011294	AAAG	2	8	4644	4651	75 %	0 %	25 %	0 %	207855519
108	NC_011294	GCT	2	6	4718	4723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855519
109	NC_011294	CAT	2	6	4728	4733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855519
110	NC_011294	CTGC	2	8	4734	4741	0 %	25 %	25 %	50 %	207855519
111	NC_011294	GCC	2	6	4749	4754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855519
112	NC_011294	TGA	3	9	4765	4773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855519
113	NC_011294	TG	3	6	4912	4917	0 %	50 %	50 %	0 %	207855520
114	NC_011294	TCA	2	6	4927	4932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855520
115	NC_011294	AAT	2	6	4992	4997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	207855520
116	NC_011294	TCA	2	6	5006	5011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855520
117	NC_011294	CG	3	6	5015	5020	0 %	0 %	50 %	50 %	207855520
118	NC_011294	T	6	6	5022	5027	0 %	100 %	0 %	0 %	207855520
119	NC_011294	ACC	2	6	5041	5046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855520
120	NC_011294	TCA	2	6	5065	5070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855520
121	NC_011294	TTC	2	6	5104	5109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855520
122	NC_011294	CAC	3	9	5148	5156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855520
123	NC_011294	CG	3	6	5234	5239	0 %	0 %	50 %	50 %	207855520
124	NC_011294	AG	3	6	5316	5321	50 %	0 %	50 %	0 %	207855520
125	NC_011294	TGT	2	6	5332	5337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	207855520
126	NC_011294	CAAAAT	2	12	5342	5353	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	207855520
127	NC_011294	CGT	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855520
128	NC_011294	GCG	2	6	5519	5524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855520
129	NC_011294	GCT	2	6	5552	5557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855520
130	NC_011294	AATCAG	2	12	5637	5648	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	207855520
131	NC_011294	CG	3	6	5735	5740	0 %	0 %	50 %	50 %	207855521
132	NC_011294	ACC	2	6	5860	5865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855521
133	NC_011294	CAA	2	6	5874	5879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	207855521
134	NC_011294	TGA	2	6	5951	5956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855521
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373	NC_011294	AGAGC	2	10	19138	19147	40 %	0 %	40 %	20 %	207855533
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386	NC_011294	CCTGA	2	10	19679	19688	20 %	20 %	20 %	40 %	207855533
387	NC_011294	CGG	2	6	19699	19704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855533
388	NC_011294	GACCAT	2	12	19820	19831	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	207855534
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